Digital Fortress mengisahkan Susan Fletcher, seorang ahli kriptografi yang bekerja untuk National Security Agency (NSA). Ketika mesin pemecah kode milik NSA menghadapi sebuah kode yang tidak dapat dipecahkan, Susan ditugaskan untuk mengungkap rahasia di baliknya. Pada saat yang sama, tunangannya, David Becker, dikirim ke Spanyol untuk mencari kunci yang dapat membuka kode tersebut. Penyelidikan mereka kemudian membawa mereka ke dalam jaringan konspirasi, pembunuhan, dan ancaman terhadap keamanan nasional. Novel ini mengangkat tema teknologi, privasi, kriptografi, keamanan informasi, pengawasan pemerintah, serta konflik antara keamanan negara dan kebebasan individu.