Pralaya melanjutkan kisah manusia setelah tercapainya gencatan senjata antara Bumi dan peradaban Trisurya melalui Teori Belantara Gelap. Dengan ancaman invasi yang untuk sementara mereda, umat manusia kembali mengembangkan ilmu pengetahuan dan mulai menjelajahi luar tata surya. Namun, manusia kemudian menyadari bahwa alam semesta jauh lebih luas dan berbahaya daripada yang mereka bayangkan, dan Trisurya bukan satu-satunya peradaban yang perlu diwaspadai. Novel ini mengeksplorasi kelangsungan hidup umat manusia, peradaban luar angkasa, perkembangan teknologi, konflik antardunia, dan nasib manusia di tengah luasnya alam semesta.